Keskkonna mikrobioloogia ja biotehnoloogia labor
DNA/RNA eraldamine keskkonna proovidest sh vesi, setted, muld, tehnogeenne pinnas. Lisaks tavalisele PCR rakendatakse kvantitatiivset PCRi geenide arvukuse määramiseks eri tüüpi proovidest. Uue põlvkonna sekveneerimisel toimub DNA raamatukogude valmistamine sõltuvalt projektist kas kohapeal või teenuse pakkuja laboris. Põhiosa järjestuste bioinformaatilisest analüüsist toimub pilvearvutusena Tartu Ülikooli arvutuskeskuses. Lisaks DNA/RNA põhistele analüüsidele on laboril võimekus teostada erinevaid mulla ja vee mikroobide aktiivsuse määramise näitajaid (sh ISO standarditele vastavad näitajad).
Asukoht: TÜ geograafia osakond Vanemuise tn 46 Tartu. Ruumid: 132-134
Kontaktisikud:
Laboriga seotud küsimused – teadur Mikk Espenberg (e-mail: mikk.espenberg [ät] ut.ee, telefon: 737 6843)
Konsultatsioonid:
Kvantitatiivne PCR – teadur Mikk Espenberg (mikk.espenberg [ät] ut.ee)
Metagenoomide ja mikroobide metaboolseid radu kodeerivate geenide analüüs – teadur Mikk Espenberg (mikk.espenberg [ät] ut.ee)